brew updateしようとしたら以下の様なエラーが発生しました。
$ brew update error: unable to unlink old 'bin/brew' (Permission denied) Error: Failure while executing: git pull --ff --no-rebase --quiet origin refs/heads/master:refs/remotes/origin/master
https://github.com/Homebrew/homebrew/issues/3247#issuecomment-548941 を参考にして権限を変更してから実行したら、またエラーが発生してしまいました。
$ brew update ... ... ... Could not restore untracked files from stash Error: Failure while executing: git stash pop --quiet
今度はbrew doctorしてみました。そこで出てた警告を解決してみます。
Warning: Xcode 7 lacks the 10.10 SDK which can cause some builds to fail. We recommend installing the Command Line Tools with: xcode-select --install to resolve this issue.
こちらを実行してみたら、なぜかxcodeのcommand line toolsがないからインストールしてくださいと言われたのでインストールしました。
それから再度brew updateしてみたら問題なく正常終了しました。
原因は何かの拍子にxcodeのcommand line toolsがアンインストールされてしまったことだったようです。